Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAT1Q99536 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms