Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPS6KC1Q96S38 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms