Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED4Q96RK1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms