Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM3Q96MX0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms