Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JSRP1Q96MG2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms