Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms