Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SENP8Q96LD8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SENP8Q96LD8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms