Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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