Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms