Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms