Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSBG1Q96GR2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSBG1Q96GR2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms