Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NXPE2Q96DL1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms