Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms