Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC1Q96C34 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms