Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMTQ93088 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms