Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRUQ92729 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRUQ92729 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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