Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP3Q8WYN3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms