Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHIPQ8WWQ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms