Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMFBP1Q8TBY8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMFBP1Q8TBY8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMFBP1Q8TBY8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMFBP1Q8TBY8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMFBP1Q8TBY8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMFBP1Q8TBY8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMFBP1Q8TBY8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms