Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC9Q8TBE3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms