Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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