Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD35Q8N283 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms