Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
YTHDF3Q7Z739 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms