Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms