Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms