Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC149Q6ZUS6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms