Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC73Q6ZRK6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms