Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms