Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSTM1Q6UX27 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms