Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C16orf54Q6UWD8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms