Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED9Q6R2W3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms