Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRNP1Q6NT89 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms