Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms