Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms