Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM225Q6GV28 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms