Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VIRMAQ69YN4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms