Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms