Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALS2CLQ60I27 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms