Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRC38Q5VT99 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC38Q5VT99 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms