Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOGA3Q5TF21 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOGA3Q5TF21 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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