Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDSS1Q5T2R2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms