Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEXMIFQ5QGS0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEXMIFQ5QGS0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms