Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms