Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms