Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms