Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms