Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms