Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P3H1Q32P28 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P3H1Q32P28 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms