Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms