Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RRN3P1Q2M238 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms